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Atelier RNA-Sequencing [N°5 Niveau 2]

OBJECTIFS

 - Acquisition des connaissances de base sur les technologies de séquençage à haut débit (HTS)
- Mieux appréhender les questions abordées par l’analyse du transcriptome
- Définir un plan expérimental précis pour les analyses transcriptomiques
- Connaître et comprendre les principales étapes des analyses RNA-Seq
- Utiliser, de façon autonome, les outils d'analyse et exploration des résultats RNA-seq
- Appliquer les méthodes présentées à l’analyse de génomes d’intérêt

PROGRAMME
Jour 1
- Qu’est ce que le RNA-seq ?
- Questions abordées par l’analyse du transcriptome
- Comparaison avec une autre méthode : les puces à ADN
- Particularités et inconvénients à prendre en compte
- Présentation des technologies de séquençage à haut débit (HTS) : principes, forces et faiblesses.
- Recommandations pour construire un plan d’expérience RNA-seq
Jour 2
- Workflow d’analyse des données RNA-seq et intégration
- Traitement des données
- Visualisation
- Normalisation des données : pourquoi et comment ?
- Tests statistiques pour l’expression différentielle des gènes.
- Exemples d'utilisation

MODALITES

 Durée : 10 heurs réparti sur 1 jour et demi
Horaires : 9H-12H30 ou 13H30-17H00
Date et Lieu 1 : 6 et 7 Mai 2015 (un jour et demi)
Salle de formation Copie Max - sortie haut de l'université de Blida à coté de Popaye

TARIF

 Coût étudiant: 2.500 DA
Coût enseignant/chercheur : 3.500 DA

INSCRIPTION

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